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  1. 大和・紀伊半島学研究所 共生科学研究センター
  2. 学外刊行物(共生科学研究センター)
  3. 雑誌

Significance of Histidine Hydrogen–Deuterium Exchange Mass Spectrometry in Protein Structural Biology

http://hdl.handle.net/10935/0002006023
http://hdl.handle.net/10935/0002006023
0a17b05d-506b-4f74-a53d-c854f1f15ed2
名前 / ファイル ライセンス アクション
/ https://doi.org/10.3390/biology13010037
アイテムタイプ default_学術雑誌論文 / Journal Article(1)
タイトル
タイトル Significance of Histidine Hydrogen–Deuterium Exchange Mass Spectrometry in Protein Structural Biology
言語 en
言語
言語 eng
キーワード
言語 en
主題Scheme Other
主題 histidine
キーワード
言語 en
主題Scheme Other
主題 histidine protonation
キーワード
言語 en
主題Scheme Other
主題 acid dissociation constant
キーワード
言語 en
主題Scheme Other
主題 mass spectrometry
キーワード
言語 en
主題Scheme Other
主題 protein structural biology
資源タイプ
資源タイプ識別子 http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
資源タイプ journal article
アクセス権
アクセス権 metadata only access
アクセス権URI http://purl.org/coar/access_right/c_14cb
著者 中澤 隆

× 中澤 隆

KAKEN2 1000030175492

ja 中澤 隆

ja-Kana なかざわ たかし

en Takashi Nakazawa

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Masaru Miyagi

× Masaru Miyagi

en Masaru Miyagi

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抄録
内容記述タイプ Abstract
内容記述 Histidine residues play crucial roles in shaping the function and structure of proteins due to their unique ability to act as both acids and bases. In other words, they can serve as proton donors and acceptors at physiological pH. This exceptional property is attributed to the side-chain imidazole ring of histidine residues. Consequently, determining the acid-base dissociation constant (Ka) of histidine imidazole rings in proteins often yields valuable insights into protein functions. Significant efforts have been dedicated to measuring the pKa values of histidine residues in various proteins, with nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy being the most commonly used technique. However, NMR-based methods encounter challenges in assigning signals to individual imidazole rings and require a substantial amount of proteins. To address these issues associated with NMR-based approaches, a mass-spectrometry-based method known as histidine hydrogen–deuterium exchange mass spectrometry (His-HDX-MS) has been developed. This technique not only determines the pKa values of histidine imidazole groups but also quantifies their solvent accessibility. His-HDX-MS has proven effective across diverse proteins, showcasing its utility. This review aims to clarify the fundamental principles of His-HDX-MS, detail the experimental workflow, explain data analysis procedures and provide guidance for interpreting the obtained results.
言語 en
書誌情報 en : Biology

巻 13, 号 1, p. 37, 発行日 2024
出版者
出版者 MDPI AG
言語 en
ISSN
収録物識別子タイプ EISSN
収録物識別子 2079-7737
DOI
識別子タイプ DOI
関連識別子 10.3390/biology13010037
権利
権利情報 © by the authors.
言語 en
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Ver.1 2025-02-06 05:25:31.529295
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